TUJUAN        : 1.  Mewujudkan tercapainya Pola Ilmiah Pokok (PIP) STAIN Kudus. 2.  Memberikan pelayanan yang cepat, tepat, dan memuaskan serta sesuai dengan peraturan perundang-undangan yang berlaku. 3.  Meningkatkan kinerja semua unit kerja di lingkungan STAIN Kudus. 4.  Meningkatkan akreditasi Institusi dan Program Studi. 5.  Mendukung terlaksananya kerjasama nasional dan internasional. PROGRAM    :  1. Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Isi 2. Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Proses 3. Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Kompetensi 4. Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Pendidik dan Tenaga Kependidikan 5.  Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Sarana dan Prasarana 6. Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Pengelolaan 7. Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Pembiyaan 8. Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Penilaian Pendidikan 9. Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Penelitian 10.  Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Pengabdian Masyarakat 11.  Menyusun Buku Manual Prosedur dan Manual Mutu Standar Kerjasama Nasional dan Internasional